牡蛎首载于《本经》上品，云：“牡蛎，味咸寒，主伤寒寒热，温疟洒洒，惊恐怒气，除拘缓，鼠瘘，女子带下赤白。”
《别录》补充云：“微寒无*，除留热在关节，荣卫虚热来去不定，烦满，止汗，心痛，气结，止渴，除老血，涩大小肠，喉痹，咳嗽，心胁下痞热。”陶弘景注云：“方以左顾者是雄，故名牡蛎，右顾者为牝蛎”，药用左顾者，此后世处方左牡蛎之来源，然两者异无区制。
今入药之牡蛎为牡蛎科长牡蛎、大连湾牡蛎和近江牡蛎。其主要成分为碳酸钙，磷酸钙，并含有镁、铝及氧化铁等。其性味为咸涩而凉。《本经》及《别录》极言其功用主治，经方中用牡蛎之方有11首，主要取其镇静安神，破结利水及清热敛阴之功。
[运用]
（一）治烦躁、惊狂、烦惊、惊痫诸症
《本经》说牡蛎主“惊恐怒气”，说明牡蛎有重镇安神平肝之功。仲景多与龙骨配合成对应用。如治心阳虚，心神浮越烦躁症的桂枝甘草龙骨牡蛎汤；治疗心阳虚，挟痰浊扰心出现惊狂，卧起不安症的桂枝去芍药加蜀漆牡蛎龙骨救逆汤。对于由肝胆火盛引起的烦惊热痫而属于实症者，仲景多用龙骨牡蛎与大*相配以泻热平肝。如治疗少阳胆火肆逆而见烦惊的柴胡加龙骨牡蛎汤；治疗肝热化风惊痫瘐疭的风引汤。也有单独使用牡蛎者，如治疗肝旺脾虚痰郁的侯氏黑散。以上各证有实有虚，有寒有热，说明牡蛎有良好的镇静安神之功。其烦躁惊痫之证，无论寒热虚实，只要配伍恰当均可应用。
（二）治少阳气结胁下痞硬症
《别录》言牡蛎主“气结”，即是指少阳气结胁下痞硬症。《伤寒论》小柴胡汤方后云：“若胁下痞硬，去大枣，加牡蛎四两”。小柴胡去大枣加牡蛎汤即在和解少阳基础上，加牡蛎软坚破结以去胁下
痞硬。王好古云：“牡蛎……为软坚之剂，以柴胡引之，能去胁下之硬。”即指此言。《伤寒论》云：“伤寒五六日，已发汗而复下之，胸胁满微结，小便不利，渴而不呕，但头汗出，往来寒热，心烦者，此为未解也，柴胡桂枝干姜汤主之。”此乃少阳气结兼饮邪留滞，故在柴胡牡蛎疏理少阳气机，软坚破结的基础上，加桂枝干姜温阳化饮。正合“病痰饮者，当以温药和之”之意。这是用牡蛎治疗气结而兼水饮的配伍方法。
(三）治百合病渴不差症
《金匮》云：“百合病，渴不差者，括蒌牡蛎散主之。”此为阴液亏损，虚火上炎，灼伤津液之证。张元素云：“壮水之主，以制阳光，则渴饮不思，，故蛤蛎(即牡蛎）之属，能止渴也。”说明牡蛎能养
阴清热，故配合栝蒌清热生津，益阴潜阳，引火下行。水盈火降，则口渴自止。《别录》说牡蛎能“止渴”，就是指这种情况。
(四）治水结之症
牡蛎在柴胡桂枝干姜汤中用于气结水停外，还用于下列二种水结之症：
1.大病差后腰以下水肿症。《伤寒论》云：“大病差后，从腰以下有水气者，牡蛎泽泻散主之。”此水结凝结虽见于大病之后，却属邪实之症。不可因大病之后而误认为虚。其病机为水热互结，三焦气化不利。治用牡蛎泽泻散，破结逐水泻热。本方以牡蛎为君，目的有二：
（1）破水热之结：结散则水热之邪自行下行。
（2）利水除湿：钱天来云：“牡蛎咸而走肾，得柴胡方能去胁硬，同渗利则下走水道。”正是指此而言。本方虽不若十枣汤之猛，但其泻水之力亦相当可观，非体壮邪实者不可轻用。
2.治妊娠湿阻胞脉症。《金匮》云：“妊娠养胎，白术散主之。”此症气血所以不能养胎是因脾虚湿阻所致。白术散用牡蛎破水结，配白术健脾燥湿。尤在泾说：“白术散，白术牡蛎燥湿”，正说明这个问题。牡蛎泽泻散属实而病重，白术散属虚而病短，药随症转，正是仲景用药的心法。
（五）治遗泄梦交症
《金匮》云：“夫失精家，少腹弦急，阴头寒，目眩发落，脉极虚芤迟，为清谷、亡血、失精。脉得诸芤动微紧，男子失精，女子梦交，桂枝加龙骨牡蛎汤主之。”此乃阴虚不函其阳，虚阳上浮而不敛，阳虚不能卫护其阴，则虚阴失其固守而不藏。本方在燮理阴阳基础上加龙骨牡蛎交通心肾，潜阳入阴，固肾涩精。周岩说：“牡蛎治惊恚而又止遗泄者，以阳既戢而阴即固也。”说的是非常确切的。
牡蛎在经方中用量大小不等，煎剂最大者五两，少者二两。现代每日量为15~30克。除收敛固脱者煅用外，余皆生用。
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